Rozlišuje sa medzi platobným orgánom a plaobnými jednotkami.
Platobný orgán – Ministerstvo financií SR – je zodpovedné za finančnú kontrolu finančnej pomoci z EÚ a za finančnú kontrolu orgánov štátnej správy pôsobiacich v tomto procese.
Platobný orgán je zodpovedný za:
- koordináciu systému finančného riadenia štrukturálnych fondov
- koordináciu platobných jednotiek, riadiacich a sprostredkovateľských orgánov pri fin. Riadení ŠF,
- vykonávanie kontrol na všetkých úrovniach finančného riadenia,
- príjem prostriedkov EÚ, prevod finančných prostriedkov štrukturálnych fondov na príjmový účet príslušného ministerstva,
- prevod finančných prostriedkov ŠF konečnému prijímateľovi pomoci prostr. Platobnej jednotky.
Platobnými jednotkami sú ministerstvá zodpovedné za implementáciu jednotl. Priorít programových dokumentov, konkrétne ich organizačné zložky.
Platobné jednotky sú zodpovedné za:
- zabezpečovanie prevodu finančných prostriedkov z EÚ a zdrojov spolufinancovania zo ŠR konečným prijímateľom,
- zabezpečovanie predbežnej kontroly pred uskutočnením platieb, vrátane kontroly žiadostí o platbu,
- vedenie finančných záznamov a výkazov v súlade so smernicami EÚ a národnými predpismi.
